韩国海军由海军本部、作战司令部、陆战队司令部、军需司令部、教育司令部、填海基地司令部、3个舰队组成。总兵力约6万人、海军陆战队2.4万人。舰艇总吨位约20万吨。

第1舰队驻在东海，负担东海作战警备区的巡逻警戒和防御作战任务。编有第1战斗团、北坪防御司令部、2个战队、2个基地战队、1个教育训练战队，同时在镇海、济州、新村设有前进基地，集中部署有韩国海军大部分P-3C反潜机飞机。第1舰队的责任海区地处前沿，作战任务较重。

第2舰队驻在平海，负责西海作战警备区的巡逻警戒和防御作战任务。编有第2战斗团、仁川特定海警备域防御司令部、防御战队、预警战队、教育训练战队、基地战队各1个。第2舰队负责守卫首都重要门户，作战任务最重。

第3舰队驻在釜山，负责南海作战警备区的巡逻警戒和防御作战任务。编有第3战斗团、木浦防御司令部、济州防御司令部、2个战队、预警战队、教育训练战队、基地战队各1个。第3舰队任务是近海防御和反渗透。