旗舰，是海军舰艇编队、舰队的灵魂和中枢。在航行中，它根据敌情、海情指挥组成合适的队形，选择、指定航向、速度，组织可靠的观察和防御。在战时，它按预定方案或根据当面敌情进行运筹决策，指挥整个编队进行战斗。“蓝岭”号和“惠特尼山”号是美国专为第七舰队和第二舰队建造的两艘专用指挥舰，在多次演习中，证明了专用指挥舰比兼职旗舰要优越得多。“拉萨尔”号担负波斯湾、阿拉伯海和印度洋区防务的中东特混舰队旗舰，是由“罗利”级船坞运输舰改装而成，该舰在海湾战争中曾参与协调指挥中东特混舰队。“科罗拉多”号是美国第三舰队旗舰，曾担任过中东特混舰队、第六舰队旗舰。1986年11月起，担任第三舰队旗舰。“贝尔纳普”号导弹巡洋舰，1986年开始担任第六舰队旗舰，它是美海军中惟一作为舰队旗舰的作战舰只。由此可见，美国有5艘可以承担战略编队任务的旗舰，它的指挥控制系统是“技高一筹”。