1943年3月，美海军在太平洋北部逐步取得了战略主动权，为加速控制海洋和夺占岛屿，它又组建了第五舰队，属太平洋舰队管辖。成立之初，因太平洋战争即将结束，所以战绩平平。它于1945年4月参加冲绳战役时，显示了一下实力。4月7日在迎战日本海军舰队时，击沉日本战列舰、巡洋舰各1艘和驱逐舰4艘，其中号称“不沉的战舰”的“大和”号战列舰就是在此战中被击沉的。这一战基本解除了日本海军对海上的威胁，美国所有的舰队基本上没有什么作战任务了。日本投降后，第五舰队也于1947年解散。

在1995年7月，这支封存了50多年的第五舰队又重新出现在中东地区，复出的原因是美国要巩固在中东的“盟主”地位，确保盛产石油的海湾地区“安全”，新复出的第五舰队就是担负这个任务的。第五舰队的辖区是印度洋和波斯湾，指挥部设在巴林岛上，直接听命于美国中央指挥部。

说到这里．你可能会提出：第五舰队的任务区是印度洋，这和太平洋舰队的任务区不是有重叠吗?美海军是这样解决的，因第五舰队复出晚，指挥关系仍属太平洋舰队。